Hajime Kindaichi, 37 tahun . Semasa SMA sering membongkar kasus kejahatan, tetapi saat ini dia hanya pegawai kantoran biasa yang sulit naik pangkat di perusahaan PR kecil. Pada suatu hari, dia dipaksa atasannya untuk menjadi penanggung jawab event tur perjodohan yang dilaksanakan di pulau terpencil. Begitu membaca rancangan acaranya, Kindaichi terkejut mengetahui bahwa pulau yang dimaksud Utashima, tempat Gedung Opera dulu berada! Sudah tiga kali terjadi kasus pembunuhan di sana dan semua dipecahkan oleh Kindaichi. Kini, dia merasakan firasat buruk lagi. Meski sudah berjanji takkan memecahkan misteri lagi, Kindaichi tetap dibayang-bayangi oleh sosok Phantom