10 tahun setelah gempa besar Tokyo ... Ganta Igarashi, salah satu korban yang selamat, menjalani hari-hari yang penuh kedamaian sebagai siswa SMP bersama teman-teman sekelasnya. Tapi, kemunculan laki-laki merah di sekolahnya mengacaukan hidup Ganta! Gawatnya Ganta yang tak bersalah malah dituduh sebagai pembunuh, divonis hukuman mati, dan akhirnya dikirim ke penjara swasta Deadman Wonderland yang penuh misteri...