Byakuya, ayah Senku, pulang kembali ke bumi setelah umat manusia membatu . Apakah yang yang ditinggalkannya untuk sang putra dengan melampaui waktu ribuan tahun? Sementara itu, Senku dkk. menerima serangan pembunuh dari kekaisaran Tsukasa. Di tengah keadaan darurat, mereka mulai mengembangkan pedang sains, senjata terkuat untuk melindungi desa!!