Dengan ibukota lama sebagai panggungnya, Conan dan Heiji mendekati sebuah misteri yang disembunyikan oleh sejarah!! Kasus pembunuhan berantai pun terjadi di Tokyo, Osaka, dan Kyoto . Semua korbannya adalah anggota kelompok pencuri Genjibotaru!? Inilah versi komik dari Detektif Conan The Movie yang sudah mendunia!!